ZEPHIR consta de tres paquetes principales: gestión de mercancías, contabilidad y producción. Existen paquetes y módulos adicionales para cada paquete principal que proporcionan más funciones. La base de todos los paquetes y módulos es siempre la gestión de mercancías del paquete principal. Todas las funciones se basan en este paquete. Los paquetes principales y adicionales incluyen siempre una licencia de uso. El número de usuarios puede ampliarse con licencias de usuario adicionales para el paquete correspondiente. El número de usuarios de los módulos depende siempre del número de licencias disponibles para el paquete principal.